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蛋白分子与蛋白对接 1、蛋白分子与蛋白对接为了研究Y蛋白与X蛋白分子间的结合区域及相互作用模式,本研究采用专业的蛋白-蛋白和蛋白-DNA/RNA对接的HDCOK程序,进行对接,选取 蛋白与金属离子结合计算 1、蛋白结构准备1.1 蛋白结构准备预测的结构如下:由拉曼图分析发现,该蛋白结构合理,可以用于分子对接。1.2 金属离子结构准备采用MOE2015进行离子结构构 多肽和蛋白对接计算 多肽和蛋白对接计算1. 方法:从PDB数据库下载蛋白(,使用pymol软件将蛋白的结构另存,用spdbv软件补充缺失原子。然后再下载多肽结构,并使用pymol 分子间相互作用分析计算 分子间相互作用分析计算简介 分子间相互作用是指分子之间发生的各种力和相互作用,这些力和相互作用对于物质的性质和行为起着重要的作用。 分子间相互作用起源于电 蛋白与蛋白对接分析计算 1、蛋白结构建模X蛋白结构由客户直接提供。由于V的蛋白结构的电荷有所缺失,不利于后续的分子对接,采用tfold程序!对该序列进行从头建模,从而获得可用于后续分子 共1页 5条
186 6240 7040 2746 12474@qq.com 江苏省苏州市吴中区胥口镇顾巷路228号 关注官方公众号 有限元仿真 结构强度分析 流体CFD仿真 热仿真分析 电磁场分析 离散元仿真 声学光学化学 分子动力学 分子对接计算 分子互作模拟 药物相关模拟 动力学后数据 第一性原理 电子性质计算 结构性质计算 材料性质计算 催化性质计算 能量性质计算 光声磁性质计算 量子化学 分子性质预测 化学反应机理 光谱预测计算 弱相互作用 激发态反应